榴莲的存放时间与成熟度有关，如成熟度较高的榴莲，在常温下只能放1-2天，如是还没完全成熟的榴莲，可以保存5天左右。榴莲可放入冰箱保存，但要将其密封严实，否则会与冰箱中其它物品发生串味。吃不完榴莲果肉，可用保鲜膜将其包裹好，再装入保鲜盒或塑料袋中密封起来，放入冰箱冷藏保存。
榴莲属于纯热带作物，榴莲的物候学特征生长所在地日平均温度22℃以上。无霜冻的地区可以种植，中国海南省和云南省的部分地区可以发展。因为榴莲要终年高温的气候才能生长结实，即使在赤道地区，海拔600m以上的高地，由于气温下降，也不能种植榴莲或不能结果。
剥榴莲的时候最好不要把所有的果肉都剥出来，可以留一些果壳。吃不完的榴莲肉可以用报纸连果壳一起包住，放在室内阴凉处或者冰箱冷藏室内。这样的保存一般能保鲜三天左右。到吃的时候如果闻到酸味或者酒味，就证明已经变质，不应该继续食用了。
冷冻榴莲是最常见也最受欢迎的榴莲保存方式。将果肉剥出，放在密封的保鲜盒或者用保鲜袋装好，放入冰箱的冷冻层。等到要吃的时候稍微解冻，用勺子勺着吃，会有雪糕的口感和风味。榴莲奶昔是处理吃剩的榴莲的一个很不错的方式。把榴莲果肉搅拌至溶烂状，加入等量的牛奶搅拌，然后放进冰箱冷冻室，大概冷冻2小时之后再搅拌一下。这样的二次搅拌可以让奶昔变得更加细腻。
